Il y a bien longtemps à l'époque des pyramides, les pharaons étaient passionnés par un jeu dont la
puissance était terrible. Mais ce jeu des ombres se transforma en guerre menaçant de détruire le monde
entier. Jusqu'au jour où un courageux pharaon réussit à enfermer cette puissance destructrice dans les
objets mystiques du millenium. Maintenant, 5000 ans plus tard, un garçon du nom de Yugi libère le secret
du puzzle du millenium. Il est imprégné des anciennes énergies magiques car son destin est de défendre le
monde contre le retour sur Terre du jeu des ombres, comme le fit en son temps le courageux pharaon il y a
5000 ans.
Yugi est un garçon timide et chétif, plus petit que les autres jeunes de son âge. C'est pourquoi, ces
camarades le tourmentent volontiers. Mais, parce qu'il possède un grand coeur, il leur pardonne toujours.
Un jour, à force de persévérance, il parvient à composer le puzzle millénaire que lui a offert son grand-père.
Dès lors, il utilisera les pouvoirs magiques que lui procure l'objet, pour punir tous ceux qui se rendent
coupables de méchanceté envers ses amis. On ignore ce qu'est réellement ce puzzle millénaire. On sait
toutefois qu'il provient d'Egypte et qu'il a un jour abouti dans la boutique de jeux dont le grand-père de Yugi
est propriétaire. Ce puzzle millénaire que Yugi porte toujours autour du cou semble lui procurer une
deuxième personnalité très différente du petit garçon craintif, "l'autre Yugi" a une grande confiance en soi et
n'hésite pas à défier ses ennemis à un jeu dont l'insu est le jeu de la sanction pour le perdant.
Le petit groupe composé de Yugi, Joey, Tristan et Téa vont faire face à des adversaires sans moralité qu'ils
vont défier à des jeux sans cesse différents...